Identifikasi Molekuler dan Hubungan Kekerabatan Spesies Ikan yang Ditemukan Selama Proses Upwelling di Perairan Alor Kecil.

HAPSARI, Sakuntala Kusumaning (2026) Identifikasi Molekuler dan Hubungan Kekerabatan Spesies Ikan yang Ditemukan Selama Proses Upwelling di Perairan Alor Kecil. Undergraduate thesis, Fakultas Sains dan Matematika.

	Text 1. COVER_SAKUNTALA.pdf Download (148kB)
	Text 2. HALAMAN PENGESAHAN_SAKUNTALA.pdf Download (291kB)
	Text 3. PRAKATA_SAKUNTALA.pdf Download (139kB)
	Text 4. ABSTRAK_SAKUNTALA.pdf Download (239kB)
	Text 5. ABSTRACT_SAKUNTALA.pdf Download (177kB)
	Text 6. DAFTAR ISI_SAKUNTALA.pdf Download (161kB)
	Text 10. BAB I PENDAHULUAN_SAKUNTALA.pdf Download (199kB)
	Text 15. DAFTAR PUSTAKA_SAKUNTALA.pdf Download (236kB)

Abstract

Upwelling esktrem di laut Alor Kecil menyebabkan penurunan suhu drastis yang
memicu stres lingkungan dan munculnya berbagai spesies ikan dalam kondisi
pingsan di permukaan. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi spesies ikan
yang ditemukan saat fenomena upwelling menggunakan teknik DNA barcoding
dengan marker 12S rRNA, menganalisis hubungan kekerabatan spesies ikan, dan
menganalisis hubungan fenomena upwelling dengan temuan spesies ikan.
Sebanyak 31 sampel ikan dikoleksi selama peristiwa upwelling. Identifikasi
dilakukan melalui analisis morfologi dan molekuler, yang meliputi ekstraksi DNA,
PCR, sekuensing, analisis BLAST, dan rekonstruksi pohon filogenetik dengan
metode Neighbor-Joining menggunakan MEGA X. Hasil penelitian didapatkan
sebanyak 19 genus dari 31 sampel dengan 25 sampel teridentifikasi ke dalam 19
spesies yang didominasi oleh ikan karang dan satu sampel yang mengalami
kesalahan sampling. Pohon filogenetik menunjukkan hubungan kekerabatan
terdekat antara genus Taeniamia dan Ostorhinchus, serta jarak genetik terjauh
antara genus Gymnothorax dan Zanclus. Analisis menunjukkan bahwa upwelling
tidak hanya menyebabkan shock temperature pada ikan karang, tetapi juga
membawa spesies laut dalam ke permukaan. Penelitian membuktikan bahwa teknik
DNA barcoding dengan marker gen 12S rRNA efektif untuk mengungkap
keanekaragaman dan hubungan kekerabtan spesies ikan yang terdampak fenomena
upwelling ekstrem di laut Alor Kecil.
Kata kunci: Alor Kecil, DNA barcoding, gen 12S rRNA, upwelling

Item Type:	Thesis (Undergraduate)
Subjects:	Sciences and Mathemathic
Divisions:	Faculty of Science and Mathematics > Department of Biology
Depositing User:	Yemima Laras Sekarsari
Date Deposited:	18 Feb 2026 02:23
Last Modified:	18 Feb 2026 02:23
URI:	https://eprints2.undip.ac.id/id/eprint/45324

Actions (login required)

View Item

Search for collections on Undip Repository