ARSYADANI, MAULANA ARIF (2025) IDENTIFIKASI FAMILI GEN PHYTOENE SYNTHASE SECARA IN SILICO DAN VALIDASI BIOMARKER MELON (Cucumis melo L.) TERHADAP CEKAMAN SALINITAS. Undergraduate thesis, Fakultas Peternakan dan Pertanian Universitas Diponegoro.

	Text Cover Skripsi_23020221130036_Maulana Arif Arsyadani.pdf Download (183kB)
	Text BAB I-III Skripsi_23020221130036_Maulana Arif Arsyadani.pdf Download (788kB)
	Text Full Text Skripsi_23020221130036_Maulana Arif Arsyadani.pdf Restricted to Repository staff only Download (5MB)

Abstract

Penelitian ini bertujuan untuk mengkaji famili, struktur gen, motif, domain
protein, serta analisis transkriptomik gen Phytoene Synthase (PSY) secara in silico
dan validasi biomarker klorofil, karotenoid, serta respon pertumbuhan tanaman
melon terhadap cekaman salinitas. Penelitian dilaksanakan pada Oktober 2024 –
Juni 2025 di Laboratorium Fisiologi dan Pemuliaan Tanaman, Departemen
Pertanian, Fakultas Peternakan dan Pertanian, Universitas Diponegoro, Semarang.
Percobaan terdapat dua tahap yang pertama tahap identifikasi in silico. Hal
yang diamati adalah pohon filogenetik famili gen, struktur gen, motif dan domain
protein serta analisis transkriptomik gen PSY. Tahap kedua berupa validasi
biomarker dan respon pertumbuhan. Rancangan percobaan tahap kedua disusun
dalam rancangan acak lengkap (RAL) monofaktor, dengan perlakuan perbedaan
lama cekaman salinitas (250mM), yaitu 0 hari (L0), 1 hari (L1), 2 hari (L2), 3 hari
(L3), dan 4 hari (L4). Masing–masing perlakuan disusun dengan 4 ulangan,
sehingga terdapat 20 unit percobaan. Parameter yang diamati meliputi kadar
klorofil a (mg/g), kadar klorofil b (mg/g), total klorofil (mg/g), karotenoid (mg/g),
panjang akar (cm), dan tinggi tanaman (cm). Data yang diperoleh dianalisis
menggunakan analisis ragam (ANOVA) dan diuji lanjut menggunakan Uji Beda
Nyata Terkecil (BNT).
Hasil identifikasi in silico diperoleh bahwa terdapat pengelompokkan gen
PSY, terdapat kesamaan struktur famili gen PSY pada tanaman melon, terdapat
kesamaan motif dan domain protein, serta perubahan ekspresi gen PSY berdasarkan
analisis transkriptomik. Sementara, validasi biomarker dan respon pertumbuhan
menunjukkan bahwa perlakuan lama cekaman berpengaruh nyata terhadap
parameter kadar klorofil a, kadar klorofil b, total klorofil, dan kadar karotenoid,
namun tidak berpengaruh nyata terhadap parameter panjang akar dan tinggi
tanaman.
Berdasarkan hasil penelitian, identifikasi in silico menunjukkan bahwa
tanaman melon (Cucumis melo L.) memiliki gen PSY (Phytoene Synthase) yang
diduga berperan dalam merespons cekaman salinitas. Analisis validasi biomarker
dan pengamatan respon pertumbuhan menunjukkan bahwa lama cekaman salinitas
selama 4 hari menyebabkan penurunan kadar biomarker klorofil a, klorofil b, total
klorofil dan karotenoid. Hal ini mengindikasikan bahwa gen PSY dapat menjadi
kandidat gen potensial dalam studi toleransi salinitas pada melon.

Actions (login required)

View Item