Irianti, Marsya Abbel (2024) Keanekaragaman Komunitas Protista Menggunakan Metode Environmental DNA (eDNA) dengan Gen 18S rRNA pada Sedimen Telaga Balekambang, Dieng, Jawa Tengah. Undergraduate thesis, Fakultas Sains dan Matematika Undip.

	Text 1. COVER.pdf Download (38kB)
	Text 2. HALAMAN PENGESAHAN.pdf Restricted to Repository staff only Download (257kB) | Request a copy
	Text 4. ABSTRAK.pdf Download (111kB)
	Text 5. ABSTRAC.pdf Download (42kB)
	Text 6. DAFTAR ISI.pdf Download (148kB)
	Text 9. BAB I.pdf Download (120kB)
	Text 14. DAFTAR PUSTAKA.pdf Download (150kB)

Abstract

Telaga Balekambang merupakan kawasan perairan yang terbentuk oleh
aktivitas vulkanik dan terletak di Dataran Tinggi Dieng. Telaga Balekambang
mengalami ancaman berupa sedimentasi. Oleh karena itu, perlu adanya identifikasi
organisme berupa protista untuk pengendalian sedimentasi dan mengetahui
organisme penyusun ekosistemnya. Salah satu metode alternatif yang efisien dan
memiliki sensitivitas tinggi dalam organisme yang bersifat mikroskopik adalah
metode Environmental DNA atau eDNA. Penelitian ini bertujuan untuk
menganalisis jenis-jenis protista dan keanekaragaman komunitasnya menggunakan
eDNA. Sampel eDNA dikoleksi dari sedimen Telaga Balekambang. Sampel
diekstraksi dengan kit ZymoBIOMICS Fecal/Soil Microbe Miniprep. Amplifikasi
PCR dilakukan menggunakan primer 18S rRNA. Sekuensing dilakukan dengan
NGS (Next Generation Sequencing). Hasil sekuensing dianalisis secara
bioinformatika dengan QIIME 2 dan RSTUDIO. Berdasarkan analisis
bioinformatika, hasil yang diperoleh sebanyak 14.630 reads didalamnya terdapat
179 Amplicon Sequence Variants (ASVs), seluruh mikroorganisme yang ditemukan
berupa Eukariota. Komunitas protista pada Telaga Balekambang ditemukan
sebanyak 21 Famili. Pada sampel dikedua lokasi masing-masing ditemukan
sebanyak 16 Famili dan 9 Famili dengan 4 Famili yang sama pada kedua lokasi.
Hasil perhitungan Indeks Keanekaragaman (H’) menunjukan nilai 4,5 dan 3,5 yang
mengindikasikan bahwa keanekaragaman komunitasnya termasuk dalam kategori
tinggi sehingga lingkungannya menunjukkan kestabilan. Indeks Dominansi (C)
menunjukan angka 0,03 dan 0,08 mengindikasikan ekosistem tersebut memiliki
tingkat dominansi yang rendah.
Kata kunci: protista, sampel sedimen, Telaga Balekambang, eDNA, gen 18S rRNA

Actions (login required)

View Item