Search for collections on Undip Repository

Profil Komunitas Bakteri Biofouling pada Permukaan Material Kapal di Dermaga Tanjung Mas Semarang dengan Pendekatan eDNA Metabarcoding

Anggoro, Naufal Sebastian (2025) Profil Komunitas Bakteri Biofouling pada Permukaan Material Kapal di Dermaga Tanjung Mas Semarang dengan Pendekatan eDNA Metabarcoding. Masters thesis, Fakultas Sains dan Matematika Undip.

[thumbnail of Naufal Sebastian Anggoro.zip] Archive
Naufal Sebastian Anggoro.zip
Restricted to Repository staff only

Download (3MB) | Request a copy
[thumbnail of 1. HALAMAN SAMPUL.pdf] Text
1. HALAMAN SAMPUL.pdf

Download (32kB)
[thumbnail of 5. ABSTRAK.pdf] Text
5. ABSTRAK.pdf

Download (64kB)
[thumbnail of 6. ABSTRACT.pdf] Text
6. ABSTRACT.pdf

Download (63kB)
[thumbnail of 8. DAFTAR ISI.pdf] Text
8. DAFTAR ISI.pdf

Download (138kB)
[thumbnail of 11. BAB I PENDAHULUAN.pdf] Text
11. BAB I PENDAHULUAN.pdf

Download (74kB)

Abstract

Komunitas bakteri memiliki peran yang penting dalam pembentukan biofouling
pada kapal laut. Komunitas bakteri pembentuk biofouling ini dapat mengakibatkan
berkurangnya efisiensi operasional perkapalan, meningkatkan biaya bahan bakar,
memperlambat laju kapal, hingga merusak kapal khususnya pada permukaan kapal
berbahan fiber dan alumunium. Tujuan dari penelitian untuk analisis profil
komunitas bakteri penyebab terbentuknya biofouling pada permukaan kapal
berbahan fiber dan aluminium. Penelitian ini menggunakan metode eDNA
metabarcoding dengan sampel amplicon 16S rRNA dan teknologi HTS DNBSeq-
400 pada sampel biofilm biofouling material kapal fiberglass dan aluminium
dengan masing-masing tiga ulangan di daerah Pelabuhan Tanjung Emas. Data
dianalisis menggunakan perangkat lunak bioinformatik QIIME2 dengan basis data
SILVA v138 SSU RefNR99 sebagai referensi klasifikasi taksonomi, PICRUSt2,
RStudio (analisis statistik ANOVA dan PERMANOVA) dan Phyloseq package.
Hasil penelitian profil komunitas bakteri penyebab biofouling pada permukaan
kapal berbahan fiber dan aluminium memperlihatkan indeks keanekaragaman
Shannon menunjukkan keanekaragaman yang lebih tinggi pada permukaan kapal
berbahan aluminium, namun Inverse Simpson menunjukkan hasil hasil yang lebih
tinggi pada permukaan material fiber. Identifikasi genus menghasilkan 11 genus
dan 6 speies di permukaan fiber serta 8 genus dan satu speies Thalassotalea
ponticola dengan kontibusi 1,63% di permukaan alumunium. Jalur metabolisme
respirasi aerob menjadi metabolisme utama yang terjadi di material fiber dan
aluminium. Terdapat perbedaan deskriptif yang ditunjukkan dari hasil analisis
jumlah taksa unik, kelimpahan relatif pada tingkat taksa famili dan genus, LEfSe
serta prediksi jalur metabolit fungsional pada komunitas bakteri biofilm di kedua
material.
Kata Kunci : fiberglass, alumunium, NGS, Amplicon, DNBSeq

Item Type: Thesis (Masters)
Subjects: Sciences and Mathemathic
Divisions: Faculty of Science and Mathematics > Master Program in Biology
Depositing User: Suhersi Rahmadhani
Date Deposited: 06 Nov 2025 04:29
Last Modified: 06 Nov 2025 04:29
URI: https://eprints2.undip.ac.id/id/eprint/40688

Actions (login required)

View Item View Item