Ardhana, Azqia Diva Widi (2025) Studi In-Silico: Interaksi Cyanidin dan Peonidin-3-Glukosida dengan Protein HER2 sebagai Anti Kanker melalui Simulasi Dinamika Molekuler. Undergraduate thesis, Fakultas Sains dan Matematika Undip.

	Archive Azqia Diva Widi Ardhana.zip Restricted to Repository staff only Download (4MB) | Request a copy
	Text 01. Cover.pdf Download (214kB)
	Text 05. Daftar Isi.pdf Download (220kB)
	Text 09. Abstrak Bahasa Indonesia.pdf Download (183kB)
	Text 10. Abstrak Bahasa Inggris.pdf Download (176kB)
	Text 11. BAB I.pdf Download (229kB)

Abstract

Reseptor Human Epidermal Growth Factor Receptor 2 atau HER2 adalah
salah satu target terapi pada kanker payudara dikarenakan HER2 sering mengalami
overekspresi dan merupakan reseptor tirosin kinase transmembran yang mengatur
pembelahan serta pertumbuhan sel. Penelitian ini bertujuan untuk memperoleh
prediksi interaksi senyawa bioaktif sebagai inhibitor pada protein dan memperoleh
residu dan gugus penentu pada kekuatan interaksi protein dan ligan bioaktif.
Penelitian menggunakan struktur 3D protein, dengan cyanidin dan peonidin-3-
glukosida sebagai senyawa bioaktif serta lapatinib sebagai kontrol positif. Tahapan
meliputi preparasi dan validasi struktur, konfirmasi posisi ligan, simulasi pada
ekuilibrasi suhu 300 K dan tekanan 1 bar, lalu analisis RMSD, dan energi interaksi
elektrostatik serta van der Waals. Hasilnya, peonidin-3-glukosida memiliki energi
interaksi lebih rendah, kompleks yang stabil, dan lebih banyak ikatan kuat dengan
residu aktif, termasuk Ala-751 dan Val-734. Temuan tersebut menandakan afinitas
lebih tinggi dan mekanisme inhibisi peonidin-3-glukosida lebih efektif dibanding
cyanidin, sehingga peonidin-3-glukosida dapat dijadikan sebagai inhibitor pada
HER2.

Actions (login required)

View Item