Wahyuningsih, Andini Putri (2025) Studi In Silico: Interaksi Asam Galagat, Heksahidroksidifenat, dan Ellagat dengan Enzim β-Sekretase untuk Penanganan Alzheimer melalui Simulasi Dinamika Molekul. Undergraduate thesis, Fakultas Sains dan Matematika Undip.

	Archive Andini Putri Wahyuningsih.zip Restricted to Repository staff only Download (7MB) | Request a copy
	Text 1. COVER.pdf Download (257kB)
	Text 5. ABSTRAK.pdf Download (156kB)
	Text 6. ABSTRACT.pdf Download (125kB)
	Text 7. DAFTAR ISI.pdf Download (248kB)
	Text 11. BAB I PENDAHULUAN .pdf Download (356kB)

Abstract

Penyakit Alzheimer merupakan penyakit neurodegeneratif yang disebabkan oleh
pembentukan agregasi plak amiloid beta akibat aktivitas enzim β-sekretase, yang
mengganggu persinyalan di otak dan memicu kematian neuron. Inhibisi enzim ini
menjadi strategi penting untuk mencegah agregasi. Asam galagat dan asam ellagat
telah terbukti secara in-vitro sebagai inhibitor β-sekretase (BACE1) dengan nilai
IC50 masing-masing 1,29 x 10−6 M dan 3,9 x 10−6 M. Asam heksahidroksidifenat
diprediksi memiliki potensi serupa karena kemiripan struktur dan jalur
biosintesisnya yaitu biosintesis punicalagin. Penelitian ini bertujuan memprediksi
interaksi ketiga senyawa tersebut dengan enzim β-sekretase menggunakan metode
in-silico berbasis simulasi dinamika molekul pada suhu 300 K dan tekanan 1 bar
selama 50 ns. Analisis meliputi kestabilan konformasi (RMSD) dan energi interaksi
(van der Waals dan elektrostatik). Hasil menunjukkan bahwa ligan asam galagat
memiliki potensi yang kuat dan stabil sebagai inhibitor enzim β-sekretase.
Meskipun hanya memenuhi satu aturan Lipinski’s Rule of Five (LogP = 1,78),
senyawa ini tetap menunjukkan potensi besar karena profil ADME yang baik yang
mendukung bioavailabilitas dan distribusinya. Kestabilan kompleks BACE1-asam
galagat disebabkan oleh posisi ligan yang optimal di sisi aktif, kesesuaian kepolaran
ligan dengan residu sekitarnya, serta banyaknya gugus hidroksil yang membentuk
ikatan hidrogen yang memperkuat interaksi yang terjadi.

Actions (login required)

View Item