Bioprospeksi Bakteri Simbion Sponge : Bacillus velezensis Sebagai Sumber Antioksidan Melalui Analisis Whole Genome Sequencing, Molecular Docking, dan Uji In Vitro

Rahmayati, Afifah Yulita (2025) Bioprospeksi Bakteri Simbion Sponge : Bacillus velezensis Sebagai Sumber Antioksidan Melalui Analisis Whole Genome Sequencing, Molecular Docking, dan Uji In Vitro. Undergraduate thesis, Fakultas Sains dan Matematika Undip.

	Text 1. COVER.pdf Download (181kB)
	Text 2. HALAMAN PENGESAHAN.pdf Restricted to Repository staff only Download (181kB) \| Request a copy
	Text 4. ABSTRAK1.pdf Download (192kB)
	Text 5. ABSTRACT.pdf Download (191kB)
	Text 6. DAFTAR ISI.pdf Download (169kB)
	Text 10. BAB 1.pdf Download (217kB)

Abstract

Indonesia merupakan negara maritim terbesar di dunia dengan keanekaragaman
hayati laut yang sangat tinggi, termasuk keberadaan bakteri simbion sponge.
Bakteri simbion ini berpotensi menghasilkan senyawa metabolit sekunder dengan
berbagai aktivitas biologis, salah satunya adalah aktivitas antioksidan. Penelitian
ini bertujuan untuk mengetahui potensi antioksidan bakteri simbion sponge Bacillus
velezensis yang diisolasi dari sponge laut di Perairan Pulau Rote, Nusa Tenggara
Timur. Metode yang digunakan meliputi analisis Whole Genome Sequencing,
molecular docking, dan uji In Vitro dengan uji DPPH. Hasil analisis whole genome
sequencing mengungkap bahwa isolat yang sebelumnya diidentifikasi sebagai
Bacillus velezensis merupakan Bacillus cereus berdasarkan analisis orthoANI dan
sekuens 16S rRNA. Whole genome sequencing juga mengungkap keberadaan
sejumlah gen yang berperan dalam sistem pertahanan terhadap stres oksidatif,
termasuk gen penyandi enzim SOD, CAT, POD, dan Trx, serta 12 klaster gen
biosintetik (BGCs) yang berpotensi menghasilkan senyawa bioaktif. Anotasi gen
menggunakan COG, Gene Ontology (GO), dan CAZyme turut mendukung adanya
aktivitas antioksidan. Hasil molecular docking menunjukkan adanya interaksi
antara senyawa metabolit sekunder dengan reseptor Human Erythrocyte Catalase.
Uji DPPH juga mengonfirmasi aktivitas antioksidan kuat dari ekstrak metabolit
sekunder, dengan nilai IC₅₀ sebesar 73 µg/mL. Hasil penelitian ini menunjukkan
bahwa Bacillus cereus memiliki potensi sebagai sumber senyawa antioksidan
alami.

Item Type:	Thesis (Undergraduate)
Subjects:	Sciences and Mathemathic
Divisions:	Faculty of Science and Mathematics > Department of Biology
Depositing User:	Suhersi Rahmadhani
Date Deposited:	20 Oct 2025 00:50
Last Modified:	20 Oct 2025 00:50
URI:	https://eprints2.undip.ac.id/id/eprint/40139

Actions (login required)

View Item

Search for collections on Undip Repository