Syahkina, Nadilla (2025) Aplikasi DNA Barcoding dan Analisis Filogenetik untuk Identifikasi Ikan di Perairan Alor pada Peristiwa Upwelling. Undergraduate thesis, Fakultas Sains dan Matematika Undip.

	Archive Nadilla Syahkina.zip Restricted to Repository staff only Download (9MB) | Request a copy
	Text 1. COVER.pdf Download (178kB)
	Text 4. ABSTRAK.pdf Download (133kB)
	Text 5. ABSTRACT.pdf Download (140kB)
	Text 6. DAFTAR ISI.pdf Download (125kB)
	Text 9. PENDAHULUAN.pdf Download (210kB)

Abstract

Alor Kecil, desa pesisir di Kecamatan Alor Barat Laut, Nusa Tenggara Timur, memiliki
potensi ekosistem taman laut yang tinggi serta fenomena oseanografi khas berupa naiknya suhu
perairan yang rendah ke permukaan karena rotasi bumi yang terjadi tiga kali dalam setahun, yaitu
upwelling. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui jenis ikan apa saja yang ditemukan selama
fenomena upwelling, apakah ditemukan spesies ikan laut dalam dan kekerabatannya satu sama
lain. Penelitian ini menggunakan metode identifikasi secara molekuler dengan teknik DNA
Barcoding dengan menargetkan gen COI dan analisis pohon filogenetik secara neighbor-joining.
Hasil identifikasi secara molekuler menunjukan spesies yang paling terdampak didominasi oleh
ikan karang dengan 13 sample merupakan ikan karang. Terdapat pula ikan mesopelagik yang
terbawa arus menuju ke permukaan, yaitu spesies Gonostoma atlanticum. Hasil dari pembuatan
pohon filogenetik menyatakan beberapa ikan berkerabat dekat satu sama lain berdasarkan
familinya, yaitu apogonidae dengan spesies yang berkerabat diantaranya adalah spesies
Ostorhinchus aureus, Taeniamia macroptera, dan Pristiapogon kallopterus
Kata Kunci : DNA Barcoding, Upwelling, pohon filogenetik

Actions (login required)

View Item