HASNA, FADIYAH NUR and SUTOPO, SUTOPO and Lestari, Dela Ayu (2025) Identifikasi Titik Mutasi pada Gen Prolaktin (PRL) Sebagai Kandidat Penanda Genetik Ayam Kedu. Undergraduate thesis, Fakultas Peternakan dan Pertanian Universitas Diponegoro.

	Text Skripsi Fadiyah Nur Hasna BAB 1-3.pdf Download (768kB)
	Text Skripsi Fadiyah Nur Hasna_23010121130097.pdf Restricted to Repository staff only Download (1MB)

Abstract

Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi titik mutasi pada gen PRL
pada ayam Kedu sebagai kandidat Single Nucleotide Polymorphism (SNP) yang
dapat dijadikan penanda genetik. Penelitian dilaksanakan pada bulan Januari
hingga Mei 2025 di Laboratorium Genetika, Pemuliaan, dan Reproduksi, Fakultas
Peternakan dan Pertanian Universitas Diponegoro, Semarang, Jawa Tengah.
Materi penelitian yang digunakan adalah 15 ekor ayam Kedu betina umur 5
bulan terdiri dari ayam Kedu hitam jengger merah dan jengger hitam serta ayam
Kedu putih. Bahan yang digunakan yaitu kit ekstraksi Deoxyribonucleic Acid
(DNA),
alkohol,
etanol,
Phosphate
Buffer
Saline.
Tris
Borate/
Ethylenediaminetetraacetic Acid (EDTA), taq polymerase, Nuclease-free Water,
agarose, DNA stain, loading dye, DNA ladder, dan primer Alat yang digunakan
meliputi spuit 3 ml, mikropipet, tip mikroppet, lateks, vortex, dry block heater,
Centrifuge, Mesin elektroforesis horizontal, mesin Polymerase Chain Reaction
(PCR), microwave, gel tray, gel combs, dan Gel Documentation System.
Metode yang dilakukan meliputi pengambilan sampel darah, ekstraksi
DNA, amplifikasi gen PRL, elektroforesis, sekuensing, dan analisis data.
Parameter yang diamati adalah identifikasi titik mutasi, frekuensi genotip,
frekuensi alel, dan heterozigositas. Analisis data dilakukan menggunakan MEGA
12 dan dnaSP.v6.
Berdasarkan hasil analisis, didapatkan fragmen gen PRL sepanjang 553 bp
yang terletak pada situs ke-7.868 sampai 8.420 sesuai GenBank accession number
AF288765.2. Titik mutasi ditemukan pada situs ke 454 (g.8321) yang merupakan
parsimony informative sties karena terdapat dua nukleotida berbeda yang muncul
pada lebih dari satu individu. Frekuensi genotip CC sebesar 0,067, sedangkan CT
dan TT masing masing adalah 0,666 dan 0,267. Frekuensi alel C sebesar 0,4 dan
alel T sebesar 0,6. Nilai heterozigositas sebesar 0,48 yang tergolong sedang.
Berdasarkan hasil penelitian dapat disimpulkan bahwa ditemukan mutasi pada
titik ke 454 C > T dengan alel C dan T, serta membentuk genotip CC, CT, dan TT.

Actions (login required)

View Item