Lumbantoruan, Firdaud Asiat (2025) Studi Komputasi Interaksi dan Dinamika molekul Kompleks Kitosan…2M4VP. Undergraduate thesis, Fakultas Sains dan Matematika.

	Text 1. COVER.pdf Download (78kB)
	Text 5. DAFTAR ISI.pdf Download (144kB)
	Text 9. ABSTRAK.pdf Download (122kB)
	Text 11. BAB I PENDAHULUAN.pdf Download (174kB)
	Archive FIRDAUD LUMBANTORUAN.zip Restricted to Repository staff only Download (3MB) | Request a copy

Abstract

Antioksidan adalah senyawa yang mampu melindungi sel-sel tubuh dari
kerusakan akibat radikal bebas. Radikal bebas adalah molekul tidak stabil yang
dapat merusak sel dan DNA, berkontribusi pada penuaan dan berbagai penyakit.
Antioksidan bekerja dengan menetralkan radikal bebas, mencegahnya
menyebabkan kerusakan lebih lanjut. Antioksidan dapat diproduki dalam tubuh
selama metabolismenya normal. Akan tetapi, ada beberapa antioksidan yang tidak
dapat diproduksi sendiri oleh tubuh, seperti mikronutrien dan senyawa metabolik
sekunder. Antioksidan tersebut dapat ditemukan pada bahan makanan, seperti
rempah-rempah, buah-buahan, dan sayuran. Salah satunya adalah andaliman.
Andaliman (Zanthoxylum acanthopodium DC.) memiliki potensi sebagai
antioksidan karena mengandung berbagai senyawa bioaktif, terutama flavonoid,
alkaloid, saponin, steroid, dan tanin. Fungsi andaliman sebagai antioksidan adalah
menetralkan Radikal Bebas, terutama karena adanya senayawa flavonoid yang
mampu mendonorkan elektron kepada radikal bebas, sehingga menstabilkannya
dan mencegahnya merusak sel-sel sehat. Senyawa flavonoid yang terdapat dalam
andaliman adalah molekul 2-metoksi-4-vinilfenol. Akan tetapi, keefektian
antioksidan dalam andaliman bisa berkurang diakrenakan beberapa faktor seperti
suhu, pH, maupun penyimpanan. Oleh karena itu dibutuhkan suatu sistem untuk
menjaga agar senyawa antioksidan pada andaliman tidak rusak dan dapat sampai
tepat pada sel tubuh, yaitu perlu dilakukannya metode enkapsulasi.
Pada penelitian ini, metode enkapsulasi 2-metoksi-4-vinilfenol dengan
Kitosan dilakukan dengan kimia komputasi, melibatkan pemodelan molecular
docking dan dinamika molekul. Pada molecular docking dilakukan penambatan
molekul kitosan dengan 2-metoksi-4-vinilfenol yang telah diberikan variasi
monomer yaitu 2,5,10 dan 15 untuk mengetahui energi ikat dan situs aktifnya
dalam membentuk kompleks yang digunakan untuk mempelajari interaksi antar
molekul dalam aplikasi enkapsulasi obat.
Hasil kompleks dengan variasi urutan ligan digunakan untuk mempelajari
perubahan dinamika yang meliputi perubahan konformasi serta stabilitas
kompleks yang terjadi menggunakan simulasi dinamika molekul dalam aplikasi
mekanisme pelepasan obat. Dari hasil keseluruhan, diperoleh data bahwa kitosan
5…2M4VP paling stabil disbanding kompleks lainnya, dengan nilai energi
interaksi yang paling rendah yaitu -4.260 kJ/mol dan nilai RMSD paling stabil di
35-50 ns yaitu 2.480 Å.

Actions (login required)

View Item