Setiawati, Debora Hani (2025) Eksplorasi Keanekaragaman Ikan Karang di Desa Sumberkima, Bali Menggunakan Pendekatan eDNA Berbasis Oxford Nanopore Technology. Undergraduate thesis, Fakultas Sains dan Matematika.

	Text 1. COVER.pdf Download (183kB)
	Text 4. ABSTRAK.pdf Download (237kB)
	Text 6. DAFTAR ISI.pdf Download (143kB)
	Text 9. BAB I PENDAHULUAN.pdf Download (160kB)
	Archive Debora Hani Setiawati.zip Restricted to Repository staff only Download (32MB) | Request a copy

Abstract

Ekosistem terumbu karang di Desa Sumberkima, Bali merupakan kawasan
yang memiliki potensi kekayaan SDA yang tinggi. Namun, ekosistem tersebut
beserta keanekaragaman hayatinya kini semakin terancam. Oleh sebab itu,
diperlukanlah monitoring, salah satunya monitoring kehati ikan untuk memberi
gambaran tentang keadaan lingkungannya. Namun, metode konvensional yang
sering digunakan masih memiliki beberapa kekurangan, sehingga diperlukan
metode alternatif yang lebih praktis dan efektif, contohnya eDNA. Penelitian ini
bertujuan untuk menganalisis keanekaragaman hayati dan peranan ekologis ikan di
ekosistem terumbu karang, Desa Sumberkima, Bali menggunakan metode eDNA
berbasis Oxford Nanopore Technology. Sampling dilakukan di tiga stasiun berbeda
pada kawasan tersebut. Sampel air laut diekstraksi menggunakan ZymoResearch
Quick-DNA Fecal/Soil Microbe Miniprep Kit. Amplifikasi menarget daerah 12s
rRNA dan menggunakan primer MiFish-U. Metode sekuensing yang digunakan
yaitu Third Generation Sequencing (TGS) berbasis Oxford Nanopore Technology.
Analisis data dilakukan menggunakan RStudio yang meliputi keanekaragaman
spesies ikan, kelimpahan relatif, alpha diversity, distribusi, trophic level, dan jenis
makanan ikan. Sebanyak 45 spesies ikan air laut dari 21 famili telah teridentifikasi
dalam penelitian ini. Ketiga stasiun memiliki indeks keanekaragaman dan
dominansi yang tinggi dengan kemerataan berkisar antara sedang-tinggi. Terdapat
tiga spesies ikan yang distribusinya berada di luar Indonesia berdasarkan FishBase
dan penelitian terdahulu. Sebagian besar spesies ikan yang ditemukan berperan
sebagai karnivora (78%) dan sisanya adalah herbivora, omnivora, atau detritivora
(21,9%). Namun demikian, terlepas dari keberhasilan metode yang digunakan,
masih diperlukan penyempurnaan metode bagi penelitian selanjutnya agar data
yang diperoleh lebih valid dan akurat.

Actions (login required)

View Item