Permatasari, Baramukti (2025) Pendekatan DNA Lingkungan untuk Analisis Keanekaragaman Ikan Laut (Actinopteri dan Elasmobranchii) di Penangkaran Hiu, Menjangan Kecil, Karimunjawa”. Laboratorium Ekologi dan Biosistematik, Departemen Biologi, Fakultas Sains dan Matematika, Universitas Diponegoro, Semarang. Undergraduate thesis, Fakultas Sains dan Matematika.

	Text 01. Halaman Judul.pdf Download (165kB)
	Text 4. Abstrak.pdf Download (292kB)
	Text 6. Daftar Isi.pdf Download (259kB)
	Text 10. BAB I PENDAHULUAN.pdf Download (285kB)
	Archive Baramukti Permatasari.zip Restricted to Repository staff only Download (5MB)

Abstract

Salah satu tempat konservasi hiu dan pari terdapat di Pulau Menjangan Kecil,
Kepulauan Karimunjawa. Penelitian ini bertujuan untuk mengkaji keanekaragaman
ikan laut (Actinopteri dan Elasmobranchii) di lokasi perairan kolam Penangkaran
Hiu, Menjangan Kecil, Karimunjawa menggunakan pendekatan eDNA Nanopore
MinION Sequencing dengan primer MiFish 12SE dan MiFish 12SU sebagai alat
pendeteksiannya. Hasil penelitian diperoleh data keanekaragaman yakni
Actinopteri sebanyak 124 spesies dan Elasmobranchii sebanyak 11 spesies, dengan
total seluruhnya teridentifikasi 39 famili, 86 genus, dan 134 spesies. Hasil data
perbandingan antara dua sampel menunjukkan primer MiFish 12S-E dapat
mendeteksi spesies lebih banyak yakni mencakup Actinopteri dan Elasmobranchii
dengan total 64 spesies, sedangkan primer MiFish 12S-U hanya spesifik mendeteksi
44 spesies Actinopteri dengan keakuratan lebih tinggi. Penelitian ini juga
mendeteksi keberadaan spesies critically endangered yakni Carcharhinus porosus,
Carcharhinus longimanus, Glaucostegus granulatus, Glaucostegus cemiculus,
Rhyncobatus sp. Berdasarkan analisis trofik level spesies juga diperoleh spesies di
trofik level trofik level 2 sebanyak 18 spesies, trofik level 3 sebanyak 56 spesies,
dan trofik level 4 sebanyak 27 spesies. Penelitian ini memberikan gambaran tentang
keanekaragaman Actinopteri dan Elasmobranchii di perairan Penangkaran Hiu,
Menjangan Kecil, Karimunjawa dan menunjukkan bahwa eDNA metabarcoding
dengan analisis third generation sequencing merupakan metode yang dapat
diandalkan untuk mengidentifikasi keanekaragaman spesies akuatik serta
mendorong upaya aplikasi pengelolaan konservasi difokuskan terhadap
Elasmobranchii, khususnya hiu.
Kata kunci : DNA Lingkungan, eDNA, Keanekaragaman Ikan, Elasmobranchii,
Menjangan Kecil, MiFish 12SE, MiFish 12SU

Actions (login required)

View Item