Search for collections on Undip Repository

Reidentifikasi Eboni (Diospyros celebica Bakh.) Koleksi Kebun Raya Bogor Berdasarkan Pendekatan Morfologi, Fenetik, dan Multilokus DNA Barcoding

Rasyl, Chika Aureli (2025) Reidentifikasi Eboni (Diospyros celebica Bakh.) Koleksi Kebun Raya Bogor Berdasarkan Pendekatan Morfologi, Fenetik, dan Multilokus DNA Barcoding. Undergraduate thesis, Fakultas Sains dan Matematika.

[thumbnail of 1. cover.pdf] Text
1. cover.pdf

Download (208kB)
[thumbnail of 3. halaman pengesahan.pdf] Text
3. halaman pengesahan.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (176kB) | Request a copy
[thumbnail of 5. abstrak.pdf] Text
5. abstrak.pdf

Download (219kB)
[thumbnail of 6. abstract.pdf] Text
6. abstract.pdf

Download (219kB)
[thumbnail of 7. daftar isi.pdf] Text
7. daftar isi.pdf

Download (212kB)
[thumbnail of 8. daftar tabel.pdf] Text
8. daftar tabel.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (206kB) | Request a copy
[thumbnail of 9. daftar gambar.pdf] Text
9. daftar gambar.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (246kB) | Request a copy
[thumbnail of 10. daftar lampiran.pdf] Text
10. daftar lampiran.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (203kB) | Request a copy
[thumbnail of 11. BAB I PENDAHULUAN.pdf] Text
11. BAB I PENDAHULUAN.pdf

Download (231kB)
[thumbnail of 12. BAB II TINJAUAN PUSTAKA.pdf] Text
12. BAB II TINJAUAN PUSTAKA.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (332kB) | Request a copy
[thumbnail of 13. BAB III METODE PENELITIAN.pdf] Text
13. BAB III METODE PENELITIAN.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (298kB) | Request a copy
[thumbnail of 14. BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN.pdf] Text
14. BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (1MB) | Request a copy
[thumbnail of 15. BAB V SIMPULAN DAN SARAN.pdf] Text
15. BAB V SIMPULAN DAN SARAN.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (187kB) | Request a copy
[thumbnail of 16. DAFTAR PUSTAKA.pdf] Text
16. DAFTAR PUSTAKA.pdf

Download (220kB)
[thumbnail of 18. Lampiran.pdf] Text
18. Lampiran.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (2MB) | Request a copy
[thumbnail of 19. daftar riwayat hidup.pdf] Text
19. daftar riwayat hidup.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (202kB) | Request a copy

Abstract

Eboni (Diospyros celebica) merupakan tumbuhan dari suku Ebenaceae yang
dikenal karena kayu hitam berkualitas tinggi. Diospyros celebica koleksi Kebun
Raya Bogor yang berasal dari Sulawesi, Kalimantan, dan Maluku memiliki
perbedaan morfologi sehingga identifikasi spesies ini perlu dikaji ulang. Tujuan
dari penelitian ini adalah untuk mengkaji persamaan dan perbedaan karakteristik
morfologi, menganalisis hasil analisis fenetik, mengidentifikasi, dan menganalisis
hasil analisis filogenetik D. celebica koleksi Kebun Raya Bogor. Sampel D.
celebica diambil dari koleksi Kebun Raya Bogor. Studi variasi morfologi dimulai
dengan mengkarakterisasi 53 karakter organ vegetatif daun dan batang, lalu
dianalisis persamaan dan perbedaannya. Analisis fenetik dilakukan dengan
mengolah data hasil karakterisasi morfologi menggunakan software MVSP dengan
program UPGMA dan analisis PCA. Analisis filogenetik dimulai dengan ekstraksi
DNA, amplifikasi DNA menggunakan marka trnL-F, matK, dan trnH-psbA,
elektroforesis, dan sekuensing. Sekuen yang telah didapatkan diolah menggunakan
software MEGA XI. Sekuen disejajarkan dengan program ClustalW, lalu diBLAST untuk melihat homologi pada NCBI. Rekonstruksi pohon filogenetik
menggunakan metode Maximum-Likelihood dengan model Tamura 3-Parameter.
Hasil karakterisasi morfologi menunjukkan terdapat 6 karakter yang membedakan
D. celebica region Sulawesi dengan region lainnya, 5 karakter yang membedakan
D. celebica region Kalimantan dari region lainnya, dan 5 karakter yang
membedakan D. celebica region Maluku dari region lain. Hasil analisis fenetik
membentuk pohon fenogram dan scatter plot PCA yang menunjukkan terbentuknya
dua klaster, yaitu klaster I dan klaster II. Klaster I terdiri atas D. celebica region
Sulawesi, sedangkan klaster II terdiri atas D. celebica region Maluku dan
Kalimantan. Hasil filogenetik menunjukkan terbentuknya 3 klad. Klad A terdiri atas
D. celebica region Sulawesi, klad B terdiri atas D. celebica region Maluku, dan klad
C merupakan D. celebica region Kalimantan. Penelitian ini berhasil menunjukkan
bahwa D. celebica region Kalimantan dan Maluku berbeda spesies dari D. celebica
region Sulawesi.
Kata kunci: Diospyros celebica, fenetik, filogenetik, barcoding, multilokus

Item Type: Thesis (Undergraduate)
Subjects: Sciences and Mathemathic
Divisions: Faculty of Science and Mathematics > Department of Biology
Depositing User: Suhersi Rahmadhani
Date Deposited: 25 Sep 2025 07:47
Last Modified: 25 Sep 2025 07:47
URI: https://eprints2.undip.ac.id/id/eprint/38787

Actions (login required)

View Item View Item