Ar Rasyid, Rido Baharudin (2025) Biodiversitas Ikan di Telaga Menjer, Dieng melalui Pendekatan eDNA Metabarcoding menggunakan Platform Third Generation Sequencing berdasarkan Gen Penanda 12S. Undergraduate thesis, Fakultas Sains dan Matematika.

	Text 1. COVER.pdf Download (85kB)
	Text 2. HALAMAN PENGESAHAN.pdf Download (430kB)
	Text 6. DAFTAR ISI.pdf Download (2MB)
	Text 10. BAB I PENDAHULUAN.pdf Download (2MB)
	Text 14. DAFTAR PUSTAKA.pdf Download (2MB)

Abstract

Telaga Menjer, Dieng, menghadapi ancaman dari aktivitas manusia, seperti erosi,
sedimentasi, dan penurunan kualitas air akibat tingginya kandungan nutrien
organik. Penelitian ini bertujuan untuk mengkaji struktur komunitas ikan di Telaga
Menjer menggunakan metode eDNA metabarcoding dengan primer 12S-U, yang
merupakan pendekatan pertama di kawasan ini, sekaligus menganalisis
efektivitasnya dalam mengidentifikasi spesies ikan melalui analisis sampel air.
Hasil analisis menghasilkan 211 sekuens DNA dengan 119 ASV yang berhasil
mengungkap 12 spesies ikan air tawar, dengan lima di antaranya spesies endemik
dan tujuh lainnya diduga spesies introduksi, termasuk Oreochromis esculentus yang
berstatus hampir terancam menurut IUCN Red List. Penelitian ini juga
mengungkapkan keberadaan ikan invasif dan keberagaman ikan dengan berbagai
ukuran, termasuk ikan kecil yang sulit dijangkau metode konvensional. Indeks
ekologi menunjukkan keanekaragaman spesies kategori tinggi di lokasi 1 (3,53) dan
lokasi 2 (3,52), serta sedang di lokasi 3 (1,10). Indeks kemerataan tertinggi terdapat
di lokasi 1 (1), diikuti lokasi 3 (0,91) dan lokasi 2 (0,84), sementara dominansi
spesies terlihat rendah di lokasi 3 (0,33), lokasi 1 (0,006) dan lokasi 2 (0,005).
Indeks similaritas menunjukkan kemiripan komposisi spesies antar lokasi, dengan
nilai similaritas tertinggi antara lokasi 2 dan 3 (80%), diikuti lokasi 1 dan 3 (76%),
dan terendah antara lokasi 1 dan 2 (41%). Penelitian ini memberikan gambaran
komprehensif tentang biodiversitas ikan di Telaga Menjer dan menunjukkan bahwa
eDNA metabarcoding merupakan metode yang dapat diandalkan untuk mendukung
upaya konservasi serta pengelolaan ekosistem perairan yang berkelanjutan.
Kata Kunci : Biodiversitas Ikan, eDNA Metabarcoding, Oxford Nanopore,
Telaga Menjer, 12S rRNA

Actions (login required)

View Item