REVERO, JOHNATAN FEBIAN (2026) IDENTIFIKASI KOMUNITAS DECAPODA PADA AREA PENANGKAPAN UDANG DI PERAIRAN LEPAS PANTAI MORODEMAK MENGGUNAKAN eDNA METABARCODING (26dik461). Undergraduate thesis, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan.

Text Johnatan Febian Revero 26dik461.pdf Restricted to Repository staff only Download (2MB)

Abstract

Perairan lepas pantai Morodemak merupakan salah satu area penangkapan
udang yang berpotensi menghasilkan tangkapan sampingan, termasuk kelompok
krustasea Decapoda. Informasi mengenai komunitas Decapoda di wilayah ini masih
terbatas, sehingga diperlukan pendekatan yang mampu mendeteksi organisme
secara lebih luas. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui komposisi dan
keanekaragaman Decapoda, serta mendeskripsikan asal habitat, distribusi, dan
status konservasi taksa yang terdeteksi melalui eDNA metabarcoding. Sampel air
laut diambil dari tiga stasiun, yaitu MD A, MD B, dan MD C, di perairan lepas
pantai Morodemak. DNA lingkungan diekstraksi dari filter hasil penyaringan air
laut, kemudian diamplifikasi menggunakan primer MiDeca pada gen mitokondria
16S rRNA dan disekuensing menggunakan Oxford Nanopore Technology. Hasil
penelitian menunjukkan bahwa jumlah reads pada ketiga stasiun relatif seimbang,
tetapi jumlah OTU berbeda antarstasiun. Komposisi Decapoda menunjukkan
perbedaan pada tingkat famili dan spesies. Sampel MD A didominasi oleh
Panopeus americanus, MD B didominasi oleh Coralliogalathea humilis,
sedangkan MD C memiliki komposisi spesies yang lebih merata. Nilai indeks
Shannon dan Simpson menunjukkan bahwa MD C memiliki keanekaragaman dan
pemerataan taksa tertinggi, sedangkan MD A memiliki nilai terendah. Spesies yang
teridentifikasi umumnya berkaitan dengan habitat laut, bentik, terumbu, estuari,
intertidal, lumpur, mangrove, dan pesisir berpasir. Distribusi spesies bervariasi dari
Indo-Pacific, Indo-West Pacific, Eastern Pacific, hingga Western Atlantic. Seluruh
spesies memiliki status IUCN Red List kategori Not Evaluated (NE). Hasil ini
menunjukkan bahwa eDNA metabarcoding dapat memberikan informasi awal
mengenai komunitas Decapoda di area penangkapan udang, tetapi identifikasi
tingkat spesies tetap perlu ditafsirkan secara hati-hati karena bergantung pada
database referensi.

Actions (login required)

View Item