Azmi, Zerlinda Fairuz (2026) IDENTIFIKASI KERAGAMAN GEN LEPTIN PADA DOMBA DORPER. Undergraduate thesis, UNIVERSITAS DIPONEGORO.

	Text BAB 1-3_SKRIPSI_ZERLINDA FAIRUZ AZMI.pdf - Published Version Download (5MB)
	Text BAB 4 - DAFTAR PUSTAKA_SKRIPSI_ZERLINDA FAIRUZ AZMI.pdf - Published Version Restricted to Repository staff only Download (5MB)
	Text LAMPIRAN DAN BIODATA_SKRIPSI_ZERLINDA FAIRUZ AZMI.pdf - Published Version Restricted to Repository staff only Download (14MB)

Abstract

Domba Dorper merupakan bangsa domba pedaging yang memiliki
pertumbuhan cepat, kualitas karkas unggul dan kemampuan adaptasi sehingga berpotensi untuk dikembangkan melalui program pemuliaan berbasis molekuler. Salah satu gen kandidat yang berperan dalam pengaturan pertumbuhan dan metabolisme adalah gen Leptin. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi keragaman gen Leptin pada domba Dorper menggunakan metode PCR-RFLP dan sekuensing DNA. Materi penelitian berupa sampel darah dari 85 ekor domba Dorper yang berasal dari Kabupaten Malang. DNA diekstraksi menggunakan Geneid DNA Extraction Kit, kemudian diamplifikasi dengan PCR menggunakan primer spesifik gen Leptin. Deteksi variasi genetik dilakukan dengan metode PCR-RFLP menggunakan enzim restriksi BspM1, dilanjutkan sekuensing metode Sanger pada 8 sampel perwakilan. Analisis alignment nukleotida menggunakan perangkat lunak MEGA 12 dan ClustalW dengan sekuens referensi Ovis aries (Genbank HE6052961.1). Hasil analisis RFLP menunjukkan adanya beberapa pola pita, namun tidak seluruhnya mampu membedakan genotipe secara jelas. Hal ini dibuktikan dengan hasil sekuensing yang menunjukkan bahwa satu pola pita dapat merepresentasikan lebih dari satu variasi genetik, sehingga menimbulkan ketidakpastian dalam penentuan genotipe. Hasil penelitian menunjukkan adanya keragaman genetik gen Leptin dengan ditemukannya 5 titik mutasi pada daerah intron 2, meliputi 4 titik mutasi transisi yaitu g.2306 (A→G), g.2344 (T→C), g.2703 (A→G), g.2724 (T→C) dan 1 mutasi insersi pada g.2732 (insersi A). Analisis keragaman genetik menghasilkan nilai segregating sites (S) = 5, singleton variable sites (Si) = 2, dan parsimony informative sites (Pa) = 3. Oleh karena terdapat ambiguitas antara pengelompokan genotipe hasil RFLP yang dibandingkan dengan hasil sekuensing, maka peneliti perlu melakukan validasi genotipe melalui sekuensing untuk seluruh sampel penelitian serta asosiasi gen Leptin dengan sifat – sifat pertumbuhan.

Kata kunci : co-migration, domba Dorper, gen Leptin, keragaman genetik, RFLP

Actions (login required)

View Item