Analisis Environmental DNA (eDNA) Metabarcoding Dalam Mengungkap Keanekaragaman Ikan Air Tawar di Danau Batur, Bali

Yanuar, Muhammad Bintang (2026) Analisis Environmental DNA (eDNA) Metabarcoding Dalam Mengungkap Keanekaragaman Ikan Air Tawar di Danau Batur, Bali. Undergraduate thesis, Fakultas Sains dan Matematika Undip.

	Archive Muhammad Bintang Yanuar.zip Restricted to Repository staff only Download (42MB) \| Request a copy
	Text 1. COVER.pdf Download (150kB)
	Text 4. ABSTRAK.pdf Download (148kB)
	Text 2. HALAMAN PENGESAHAN.pdf Download (353kB)
	Text 5. ABSTRACT.pdf Download (117kB)
	Text 6. DAFTAR ISI.pdf Download (95kB)
	Text 10. BAB I PENDAHULUAN.pdf Download (151kB)
	Text 15. DAFTAR PUSTAKA.pdf Download (254kB)

Abstract

Danau Batur merupakan ekosistem perairan tawar terbesar di Bali yang saat ini
menghadapi tekanan ekologis berat akibat masifnya aktivitas Keramba Jaring
Apung (KJA) dan pelepasan ikan hias secara liar. Penelitian ini bertujuan untuk
mengungkap keanekaragaman spesies ikan air tawar serta mengidentifikasi taksa
introduksi di Danau Batur menggunakan teknik environmental DNA (eDNA)
metabarcoding. Pengambilan sampel air dilakukan pada sepuluh stasiun
pengamatan yang merepresentasikan variasi zona danau. Amplifikasi materi
genetik lingkungan menargetkan gen marker MiFish 12S rRNA, yang dilanjutkan
dengan pembacaan sekuens menggunakan teknologi MinION Nanopore. Analisis
bioinformatika berhasil mendeteksi 20 taksa ikan yang terdistribusi secara tidak
merata. Hasil penelitian menunjukkan bahwa berdasarkan jejak materi genetik
komunitas ikan di Danau Batur didominasi oleh spesies introduksi, khususnya
dari famili Cichlidae (Oreochromis niloticus). Sebaliknya, kelompok ikan native
seperti Nilem (Osteochilus sp.), Gabus (Channa striata), Wader (Rasbora
arundinata), dan Sepat (Trichopodus trichopterus) mengalami penyusutan relung
ekologis dan hanya terdeteksi dengan jejak materi genetik yang sangat minim.
Lebih lanjut, terdeteksinya taksa non-native yang memicu tingginya angka false
positive menegaskan indikasi polusi genetik hibrida galur budidaya dari fasilitas
KJA serta ketidaklengkapan database referensi genetik global. Dominasi taksa
introduksi ini telah merusak keseimbangan ekosistem danau, sehingga sangat
mendesak dilakukannya evaluasi tata kelola zonasi KJA serta pengayaan database
genetik ikan air tawar lokal guna mendukung langkah konservasi spesies asli.
Kata kunci: Danau, eDNA Metabarcoding, Ikan Air Tawar.

(NO KETERSEDIAAN : 2265/B/2026)

Item Type:	Thesis (Undergraduate)
Subjects:	Sciences and Mathemathic
Divisions:	Faculty of Science and Mathematics > Department of Biology
Depositing User:	Suhersi Rahmadhani
Date Deposited:	10 Jul 2026 08:17
Last Modified:	10 Jul 2026 08:17
URI:	https://eprints2.undip.ac.id/id/eprint/56430

Actions (login required)

View Item

Search for collections on Undip Repository