Eksplorasi Whole-Genome Sequencing (WGS) untuk Mengungkap Struktur Genomik dan Protein Mating-Type Pada Morchella rinjaniensis, Spesies Tropis Baru dari Indonesia

Cahyo, Iqvan Nur (2026) Eksplorasi Whole-Genome Sequencing (WGS) untuk Mengungkap Struktur Genomik dan Protein Mating-Type Pada Morchella rinjaniensis, Spesies Tropis Baru dari Indonesia. Undergraduate thesis, Fakultas Sains dan Matematika Undip.

	Archive Iqvan Nur Cahyo.zip Restricted to Repository staff only Download (5MB) \| Request a copy
	Text 2. HALAMAN PENGESAHAN.pdf Download (432kB)
	Text 4. ABSTRAK.pdf Download (71kB)
	Text 5. ABSTRACT.pdf Download (71kB)
	Text 6. DAFTAR ISI.pdf Download (146kB)
	Text 10. BAB I PENDAHULUAN.pdf Download (85kB)
	Text 15. DAFTAR PUSTAKA.pdf Download (265kB)

Abstract

Morel (Morchella spp.) merupakan jamur pangan bernilai ekonomi tinggi yang
dikenal secara luas karena cita rasanya yang khas serta semakin meningkatnya
permintaan pasar. Keberhasilan pembentukan tubuh buah dan pengembangan
budidaya dipengaruhi oleh sistem mating reproduksi seksual yang dikendalikan
oleh gen mating-type. Meskipun sifat homothalik dan heterothalik telah dilaporkan
di berbagai jenis Morchella namun, hingga saat ini organisasi gen mating-type
(MAT) pada spesies M. rinjaniensis belum diketahui. Oleh karena itu, penelitian
ini dilakukan untuk mengkaji struktur genomik dan protein lokus mating-type pada
M. rinjaniensis melalui pendekatan Whole-Genome Sequencing (WGS). Analisis
GenomeScope mengindikasikan bahwa karakteristik genom yang dianalisis
konsisten dengan pola genom haploid. Hasil perakitan menunjukkan ukuran genom
sebesar 58 Mb dengan nilai scaffold N50 sebesar 40 kb dan tingkat kelengkapan
genom berdasarkan BUSCO mencapai 95,3%. Analisis struktur protein lebih lanjut
menunjukkan bahwa memiliki tingkat konservasi domain fungsional protein MAT
dengan spesies lain dalam genus Morchella, hal ini mengindikasikan konservasi
fungsi biologis terkait reproduksi seksual. Secara keseluruhan penelitian ini
memberikan informasi baru mengenai struktur genomik lokus mating-type pada M.
rinjaniensis serta memperluas pemahaman tentang biologi reproduksi dan evolusi.
Temuan ini mampu memberikan pengembangan strategi pemuliaan dan budidaya
jamur morel tropis di Indonesia.
Kata Kunci: Morchella rinjaniensis; mating-type; WGS; AlphaFold3; morel

(NO KETERSEDIAAN : 2251/B/2026)

Item Type:	Thesis (Undergraduate)
Subjects:	Sciences and Mathemathic
Divisions:	Faculty of Science and Mathematics > Department of Biology
Depositing User:	Suhersi Rahmadhani
Date Deposited:	08 Jul 2026 09:06
Last Modified:	08 Jul 2026 09:06
URI:	https://eprints2.undip.ac.id/id/eprint/56270

Actions (login required)

View Item

Search for collections on Undip Repository