Maharani, Nabila Mona (2026) Keanekaragaman Ikan Air Tawar di Hulu Sungai Padang Bulia, Provinsi Bali melalui Pendekatan Environmental DNA Berbasis Oxford Nanopore Technology. Undergraduate thesis, Fakultas Sains dan Matematika Undip.

	Archive Nabila Mona Maharani.zip Restricted to Repository staff only Download (13MB) | Request a copy
	Text 1. COVER.pdf Download (568kB)
	Text 2. HALAMAN PENGESAHAN.pdf Download (494kB)
	Text 4. DAFTAR ISI.pdf Download (641kB)
	Text 8. ABSTRAK.pdf Download (638kB)
	Text 9. ABSTRACT.pdf Download (539kB)
	Text 10. BAB I PENDAHULUAN.pdf Download (708kB)
	Text 15. DAFTAR PUSTAKA.pdf Download (596kB)

Abstract

Keanekaragaman ikan air tawar merupakan salah satu komponen penting
dalam menjaga kestabilan ekosistem perairan sehingga perlu untuk dilakukan upaya
konservasi. Salah satu pendekatan yang dapat dilakukan yaitu dengan environmental
DNA berbasis Oxford Nanopore Technology. Pendekatan eDNA ikan air tawar di
Bali masih terbatas. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis tingkat
keanekaragaman hayati dan mengidentifikasi ikan air tawar di Hulu Sungai Padang
Bulia, Kabupaten Buleleng, Provinsi Bali. Sampel eDNA diekstraksi menggunakan
Zymo Quick-DNA™ Fecal/Soil Microbe Miniprep Kit. DNA template yang
diperoleh akan diamplifikasi dan disekuensing menggunakan platform Oxford
Nanopore Technology. Data hasil sekuensing dianalisis secara bioinformatika,
kemudian divisualisasikan dan dianalisis lebih lanjut menggunakan RStudio. Hasil
penelitian ini menunjukkan bahwa terdapat sebanyak 15 spesies ikan air tawar yang
yang tergolong ke dalam 12 genus, 4 family, dan 3 order yang berhasil terdeteksi dari
tiga sampel, diantaranya 4 spesies ikan native Indonesia dan 11 spesies ikan nonnative, yang mana 2 diantaranya terdapat kemungkinan termasuk spesies introduksi.
Indeks Shannon-Wiener menunjukkan pola keanekaragaman ikan air tawar yang
relatif serupa antar sampel dengan nilai H' pada sampel DBP012713 sebesar 5,603,
DBP012714 sebesar 5,662, dan DBP012715 sebesar 5,298, artinya komunitas ikan
yang terdeteksi memiliki kekayaan taksa dan distribusi reads yang relatif merata.
Indeks Simspson (1-D) dengan nilai mendekati 1, dimana sampel DBP012713
sebesar 0,970, DBP012714 sebesar 0,990, dan DBP012715 sebesar 0,974, artinya
memiliki keanekaragaman yang relatif tinggi dan tidak didominasi spesies tertentu.
Kata Kunci : eDNA, keanekaragaman, ikan air tawar, Sungai Padang Bulia

(NO KETERSEDIAAN : 2242/B/2026)

Actions (login required)

View Item