Studi Metabarcoding Komunitas Jamur pada Batang Tanaman Kentang di Wonosobo, Jawa Tengah

Rahayu, Nastiti (2026) Studi Metabarcoding Komunitas Jamur pada Batang Tanaman Kentang di Wonosobo, Jawa Tengah. Undergraduate thesis, Fakultas Sains dan Matematika Undip.

	Text 1. Cover.pdf Download (146kB)
	Text 2. Halaman Pengesahan.pdf Download (1MB)
	Text 4. Abstrak.pdf Download (106kB)
	Text 5. Abstract.pdf Download (89kB)
	Text 6. Daftar Isi.pdf Download (125kB)
	Text 9. Bab I Pendahuluan.pdf Download (113kB)
	Text 14. Daftar Pustaka.pdf Download (171kB)

Abstract

Metabarcoding DNA merupakan pendekatan molekuler berbasis
sekuensing berkapasitas tinggi yang efektif untuk mengidentifikasi komunitas
jamur pada jaringan tanaman secara simultan. Penelitian ini bertujuan
menganalisis komunitas jamur pada batang tanaman kentang (Solanum
tuberosum) yang bersifat simtomatik dan asimtomatik di Jawa Tengah. Sampel
batang dikoleksi dari Kecamatan Kejajar, Kabupaten Wonosobo, kemudian
dianalisis menggunakan metabarcoding DNA dengan penanda gen ITS2 melalui
Illumina MiSeq. Analisis bioinformatika dilakukan menggunakan QIIME2
dengan pipeline DADA2 untuk menghasilkan Amplicon Sequence Variants
(ASVs) dan klasifikasi taksonomi berbasis basis data UNITE. Hasil penelitian
menunjukkan bahwa komunitas jamur pada kedua sampel didominasi oleh filum
Ascomycota, dengan proporsi kelompok Incertae sedis yang lebih tinggi pada
batang simptomatik. Batang simptomatik menunjukkan jumlah ASV dan tingkat
keanekaragaman yang lebih tinggi serta didominasi oleh jamur oportunistik dan
patogen potensial seperti Fusarium, Alternaria, Diaporthe, Nigrospora, dan
Itersonilia. Sebaliknya, batang asimtomatik memiliki struktur komunitas jamur
yang lebih stabil dan didominasi oleh taksa non-patogen seperti Tetragoniomyces,
Sporobolomyces, Papiliotrema, Torula, dan Symmetrospora. Hasil ini
menunjukkan bahwa metabarcoding ITS2 mampu mengungkap perbedaan
struktur komunitas jamur secara efektif serta berpotensi digunakan sebagai
metode pendukung deteksi dini patogen tanaman kentang.
Kata kunci: metabarcoding; jamur; batang kentang.

(NO. KETERSEDIAAN 2204/B/2026)

Item Type:	Thesis (Undergraduate)
Subjects:	Sciences and Mathemathic
Divisions:	Faculty of Science and Mathematics > Department of Biology
Depositing User:	Suhersi Rahmadhani
Date Deposited:	25 Mar 2026 06:21
Last Modified:	11 May 2026 03:15
URI:	https://eprints2.undip.ac.id/id/eprint/47751

Actions (login required)

View Item

Search for collections on Undip Repository